RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 CABP1Q9NZU7 370 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 STOML1Q9UBI4 398 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPLO60437 1756 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PALLDQ8WX93 1383 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PQ67 120 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD62A6NC57 917 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGBP1P78318 339 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 VWA3BQ502W6 1294 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf183Q5T699 404 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 SATL1Q86VE3 508 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 NME8Q8N427 588 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 STAMQ92783 540 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCHPQ9BT92 498 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM94Q12767 1356 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 C4AP0C0L4 1744 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 C4BP0C0L5 1744 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 O00370 1275 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 DAPK3O43293 454 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT36O76013 467 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPREP23469 700 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 NEK2P51955 445 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 DMPKQ09013 629 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTMR3Q13615 1198 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 CUL1Q13616 776 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 WASHC4Q2M389 1173 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF394Q53GI3 561 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMC4Q7Z404 712 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PAGE5Q96GU1 130 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALG1Q9BT22 464 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 AZI2Q9H6S1 392 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 BTBD7Q9P203 1132 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.45□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 LGALS16A8MUM7 142 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 FTCDO95954 541 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPA17Q15506 151 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSTA3Q16772 222 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 NEPROQ6NW34 567 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 NACC2Q96BF6 587 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TLDC2A0PJX2 215 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBX10O75333 385 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 T-ENOLP0DO92 83 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCG2P13521 617 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGA6P23229 1130 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC6Q16204 474 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP38Q8NB14 1042 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC42Q96M95 316 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PQC6 194 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 GTF2H1P32780 548 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PMS2P54278 862 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.44□□□□□ -1.22
CACNA2D3-210ENST00000490478 PROM2Q8N271 834 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms