RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488814.5

FUBP1-210, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene FUBP1, Length 612 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-210ENST00000488814 FBXO40Q9UH90 709 aa7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 WDR90Q96KV7 1748 aa7.3□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PHIPQ8WWQ0 1821 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 BICDL2A1A5D9 508 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 E9PMD0 336 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MEIS1O00470 390 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PSMA7O14818 248 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 CHMP2AO43633 222 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 KLRC4O43908 158 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MED24O75448 989 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PLA2G4BP0C869 781 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 BCRP11274 1271 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 IDEP14735 1019 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MUTP22033 750 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 RPA1P27694 616 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 COPB2P35606 906 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PTGIRP43119 386 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 STX17P56962 302 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 FKBP1BP68106 108 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 FANCCQ00597 558 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.245e-11■■■■■ 39.1
FUBP1-210ENST00000488814 SPAG1Q07617 926 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 VAC14Q08AM6 782 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PSMD2Q13200 908 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PPP2R5CQ13362 524 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MTMR1Q13613 665 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PGM5Q15124 567 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 TREML2Q5T2D2 321 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 LBX2Q6XYB7 198 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MOB2Q70IA6 237 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 NELFBQ8WX92 580 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 OPTNQ96CV9 577 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 WNK4Q96J92 1243 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 RIT2Q99578 217 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 JADE2Q9NQC1 790 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PXMP2Q9NR77 195 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 FANCLQ9NW38 375 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 IFNKQ9P0W0 207 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 VAV3Q9UKW4 847 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 DNM3Q9UQ16 869 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 GDAQ9Y2T3 454 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 RIPK3Q9Y572 518 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.29□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MYMKA6NI61 221 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 B4DLN1 442 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 WIPF1O43516 503 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 NRDCO43847 1150 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 PSMD10O75832 226 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 STAM2O75886 525 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 KIF20AO95235 890 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 ARP10275 920 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 SCTRP47872 440 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 UBASH3AP57075 661 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 ERVK-9P63128 1117 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 SNAPC2Q13487 334 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 EPHA7Q15375 998 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 ECM1Q16610 540 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 DYMQ7RTS9 669 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 GPBP1Q86WP2 473 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 ADSSL1Q8N142 457 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 RNF217Q8TC41 542 aa7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
FUBP1-210ENST00000488814 LRRC15Q8TF66 581 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms