RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.37■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.37■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 SIP14410 1827 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 PSMC5P62195 406 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 LPIN1Q14693 890 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 XKR3Q5GH77 459 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 METTL13Q8N6R0 699 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 APBB2Q92870 758 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 COL6A3P12111 3177 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 KIF28PB7ZC32 967 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 MCM7P33993 719 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 DEFB103AP81534 67 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 EPHA7Q15375 998 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR9Q96QG7 549 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF576Q9H609 170 aa22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 STBD1O95210 358 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TXKP42681 527 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TRAPPC10P48553 1259 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 USP38Q8NB14 1042 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 GUCD1Q96NT3 240 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 SQORQ9Y6N5 450 aa22.34■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRSQ13332 1948 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 AMHP03971 560 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 MYOGP15173 224 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TMOD1P28289 359 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF174Q15697 407 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 MTERF2Q49AM1 385 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 TTC38Q5R3I4 469 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.33■■□□□ 1.17
CTPS1-206ENST00000470271 MYO9BQ13459 2157 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM150BA6NC51 233 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 H3BQV1 296 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CLCN3P51790 818 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CUL4AQ13619 759 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 MAP7D2Q96T17 732 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 LXNQ9BS40 222 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 GINS2Q9Y248 185 aa22.32■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 TLL1O43897 1013 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 GJB5O95377 273 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 VTNP04004 478 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 MCTP1Q6DN14 999 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 ANO5Q75V66 913 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 DYDC2Q96IM9 177 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 RGL1Q9NZL6 768 aa22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CA3P07451 260 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 OR52Z1P0C646 297 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CD52P31358 61 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CYP4A11Q02928 519 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 GRIN2CQ14957 1233 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 C4orf19Q8IY42 314 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 CEP89Q96ST8 783 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 AKT3Q9Y243 479 aa22.3■■□□□ 1.16
CTPS1-206ENST00000470271 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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