RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469223.5

HDAC6-217, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC6, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-217ENST00000469223 PBX3P40426 434 aa14.64□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.64□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 COL4A3Q01955 1670 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.63□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 SPTLC1O15269 473 aa14.62□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.6□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 ZNF558Q96NG5 402 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.6□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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HDAC6-217ENST00000469223 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 C9IYK1 514 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 FIBPO43427 364 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 SRFP11831 508 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 TGM1P22735 817 aa14.57□□□□□ -0.08
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