RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466579.1

SDCCAG3-208, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

TSL 1 (best)

Gene SDCCAG3, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANO5	Q75V66	913 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BRAP	Q7Z569	592 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PTPRS	Q13332	1948 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SZT2	Q5T011	3432 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MARCH6	O60337	910 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATP2B1	P20020	1258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TXK	P42681	527 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PTGDR	Q13258	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDIA5	Q14554	519 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NBR1	Q14596	966 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TCTN1	Q2MV58	587 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MCTP1	Q6DN14	999 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LXN	Q9BS40	222 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EFCAB14	O75071	495 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ACTN1	P12814	892 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MUT	P22033	750 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	REST	Q13127	1097 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IER5	Q5VY09	327 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DYDC2	Q96IM9	177 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RGL1	Q9NZL6	768 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MTMR6	Q9Y217	621 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GBF1	Q92538	1859 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM150B	A6NC51	233 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	POTEM	A6NI47	508 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPR32	O75388	356 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CTSH	P09668	335 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RPA1	P27694	616 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TEC	P42680	631 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LPIN1	Q14693	890 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IL17A	Q16552	155 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SEPT8	Q92599	483 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	APBB2	Q92870	758 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	STX6	O43752	255 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BMP15	O95972	392 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMOD1	P28289	359 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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