RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449039.5

LRRC23-210, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-210ENST00000449039 AK2P54819 239 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 PAK2Q13177 524 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 IL27Q8NEV9 243 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 PADI3Q9ULW8 664 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 NPY5RQ15761 445 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 AAK1Q2M2I8 961 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 WASF1Q92558 559 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 GINS2Q9Y248 185 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 TTC3P53804 2025 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 WDR81Q562E7 1941 aa23.14■■□□□ 1.3
LRRC23-210ENST00000449039 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 MAGEB2O15479 319 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 CHMP2AO43633 222 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 C22orf31O95567 290 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 EPC2Q52LR7 807 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ODR4Q5SWX8 454 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 FIBCD1Q8N539 461 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 METTL13Q8N6R0 699 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 RDM1Q8NG50 284 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 COG5Q9UP83 839 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 REV3LO60673 3130 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 PSMD10O75832 226 aa23.13■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 TDP2O95551 362 aa23.13■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 OATP04181 439 aa23.13■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 TMEM192Q8IY95 271 aa23.13■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.13■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 COL4A6Q14031 1691 aa23.13■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 TMOD1P28289 359 aa23.12■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 PTPROQ16827 1216 aa23.12■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 INF2Q27J81 1249 aa23.12■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.12■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 MBOAT7Q96N66 472 aa23.12■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.12■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 TTC28Q96AY4 2481 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 RPS6KA5O75582 802 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 CTDNEP1O95476 244 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 STAG3L1P0CL83 205 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 NEK4P51957 841 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 PRKCEQ02156 737 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 LETM2Q2VYF4 491 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 HLA-CQ95604 372 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 GJA10Q969M2 543 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 H3BNC9 293 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 GPR182O15218 404 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF862O60290 1169 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 GPM6BQ13491 265 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 NEK8Q86SG6 692 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 NECAB1Q8N987 351 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 MAP7D2Q96T17 732 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 DGKIO75912 1065 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 RB1P06400 928 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 TFF2Q03403 129 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ME3Q16798 604 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 KIZQ2M2Z5 673 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 GTF3C6Q969F1 213 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 TMX1Q9H3N1 280 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 AKT3Q9Y243 479 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 GPR32O75388 356 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 VTNP04004 478 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 CTNNB1P35222 781 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 UGCGQ16739 394 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRC23-210ENST00000449039 FAM20AQ96MK3 541 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms