RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 H3BQV1 296 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 PSMC5P62195 406 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 EPHA7Q15375 998 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 TIFAQ96CG3 184 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 MTMR9Q96QG7 549 aa28.09■■■□□ 2.09
HTATSF1-202ENST00000425695 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28.09■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 M0QZ92 97 aa28.08■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 TTC38Q5R3I4 469 aa28.08■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 RGL1Q9NZL6 768 aa28.08■■■□□ 2.09
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HTATSF1-202ENST00000425695 RAB30Q15771 203 aa28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 EFCAB12Q6NXP0 572 aa28.07■■■□□ 2.08
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HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC71Q8N4P6 559 aa28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 DYDC2Q96IM9 177 aa28.07■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
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HTATSF1-202ENST00000425695 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.06■■■□□ 2.08
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HTATSF1-202ENST00000425695 NPEPPSP55786 919 aa28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 KIZQ2M2Z5 673 aa28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP7D2Q96T17 732 aa28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC28A3Q9HAS3 691 aa28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa28.02■■■□□ 2.08
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB39O15060 712 aa28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-202ENST00000425695 TLL1O43897 1013 aa28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-202ENST00000425695 SLITRK3O94933 977 aa28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-202ENST00000425695 AMHP03971 560 aa28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-202ENST00000425695 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-202ENST00000425695 LINC01465Q8N7H1 131 aa28.01■■■□□ 2.07
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
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