RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP4-202ENST00000392011 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 SP8Q8IXZ3 490 aa18.53■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa18.53■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM49P0CI25 452 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM49CP0CI26 452 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPRUQ92729 1446 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 MYO3BQ8WXR4 1341 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa18.53■□□□□ 0.56
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