RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380026.7

CENPE-202, Transcript of centromere protein E, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPE, Length 8,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPE-202ENST00000380026 EPHA7Q15375 998 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 PDXDC1Q6P996 788 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 PAF1Q8N7H5 531 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 KMT5AQ9NQR1 393 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 NFU1Q9UMS0 254 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SNX12Q9UMY4 172 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 K7ERI5 159 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 PSMD14O00487 310 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 NSFP46459 744 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 CASP4P49662 377 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 ZNF653Q96CK0 615 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 CCDC114Q96M63 670 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 AP1M1Q9BXS5 423 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 AS3MTQ9HBK9 375 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 EHD2Q9NZN4 543 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 RNF14Q9UBS8 474 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 PNMA2Q9UL42 364 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 FHOD1Q9Y613 1164 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 A0A1W2PRG0 241 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 ADAMTS3O15072 1205 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 ZNF185O15231 689 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 KLRC4O43908 158 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 RNF40O75150 1001 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 DPEP1P16444 411 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 DESP17661 470 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 PRELPP51888 382 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SART1O43290 800 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 AKAP3O75969 853 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 MYZAPP0CAP1 466 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 PLTPP55058 493 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 APBA1Q02410 837 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 PTK2Q05397 1052 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SLC18A3Q16572 532 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SLC35G1Q2M3R5 365 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SCFD1Q8WVM8 642 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 ATG4CQ96DT6 458 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SAAL1Q96ER3 474 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 CDHR1Q96JP9 859 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 IDI2Q9BXS1 227 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 DEFB129Q9H1M3 183 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 TBC1D22BQ9NU19 505 aa5□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 A0A0U1RQJ8 604 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 FGGP02679 453 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 TMOD1P28289 359 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 COG1Q8WTW3 980 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 ACCSQ96QU6 501 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 OSBPL9Q96SU4 736 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SELENOSQ9BQE4 189 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 TMEM206Q9H813 350 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 DENND3A2RUS2 1198 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SPDYE2BA6NHP3 402 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SPDYE6P0CI01 402 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 USP14P54578 494 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 KCTD2Q14681 263 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 EHD4Q9H223 541 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 DLG5Q8TDM6 1919 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 EPHB6O15197 1021 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 LMNB1P20700 586 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 KRT76Q01546 638 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 GABPAQ06546 454 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 KSR1Q8IVT5 923 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 METTL13Q8N6R0 699 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 HAS1Q92839 578 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 FAM86B1E9PN63 330 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 ABL1P00519 1130 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 MYBP10242 640 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 EPHB4P54760 987 aa4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CENPE-202ENST00000380026 IL17AQ16552 155 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms