RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 INPP5BP32019 993 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 JADE1Q6IE81 842 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TLK1Q9UKI8 766 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SH2D4BQ5SQS7 431 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC31Q6UY01 552 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 BARGINQ6ZT62 677 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 POTEDQ86YR6 584 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 DYDC2Q96IM9 177 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 AKR1B1P15121 316 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 NNMTP40261 264 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 APBA1Q02410 837 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SLC10A5Q5PT55 438 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 EFCC1Q9HA90 598 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SFR1Q86XK3 245 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GPT2Q8TD30 523 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 BARHL2Q9NY43 387 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 NMT2O60551 498 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ZBED1O96006 694 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TXNP10599 105 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GPC3P51654 580 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 USP11P51784 963 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PKNOX2Q96KN3 472 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 CDC23Q9UJX2 597 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SLC16A4O15374 487 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PCK1P35558 622 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GDAQ9Y2T3 454 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 MTMR2Q13614 643 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PROM2Q8N271 834 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 DCLK2Q8N568 766 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PMLP29590 882 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 CDC42EP1Q00587 391 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 C12orf60Q5U649 245 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PBKQ96KB5 322 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ADAM22Q9P0K1 906 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PSMA2P25787 234 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TKFCQ3LXA3 575 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF394Q53GI3 561 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 RABEP2Q9H5N1 569 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 FOXO4P98177 505 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SNX1Q13596 522 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SEPT6Q14141 434 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 KYAT1Q16773 422 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SLC9A2Q9UBY0 812 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 NR3C1P04150 777 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 SLC35F6Q8N357 371 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 RPS12P25398 132 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 CDC25BP30305 580 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 VEPH1Q14D04 833 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms