RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 CLIC6Q96NY7 704 aa22.6■■□□□ 1.21
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RALGPS1-202ENST00000319107 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.59■■□□□ 1.21
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RALGPS1-202ENST00000319107 CDC25AP30304 524 aa22.59■■□□□ 1.21
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RALGPS1-202ENST00000319107 BADQ92934 168 aa22.57■■□□□ 1.2
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RALGPS1-202ENST00000319107 USP49Q70CQ1 688 aa22.55■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.55■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 EPSTI1Q96J88 318 aa22.55■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 PNMA5Q96PV4 448 aa22.55■■□□□ 1.2
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RALGPS1-202ENST00000319107 SIP14410 1827 aa22.54■■□□□ 1.2
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RALGPS1-202ENST00000319107 MTERF2Q49AM1 385 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.54■■□□□ 1.2
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RALGPS1-202ENST00000319107 CEP89Q96ST8 783 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.54■■□□□ 1.2
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RALGPS1-202ENST00000319107 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 NOD1Q9Y239 953 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBTB39O15060 712 aa22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 C22orf31O95567 290 aa22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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RALGPS1-202ENST00000319107 SERINC5Q86VE9 423 aa22.53■■□□□ 1.2
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RALGPS1-202ENST00000319107 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.53■■□□□ 1.2
RALGPS1-202ENST00000319107 VCANP13611 3396 aa22.53■■□□□ 1.2
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