RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.481e-7■■■■□ 23
GRAMD1A-201ENST00000317991 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.489e-18■■■■■ 42
GRAMD1A-201ENST00000317991 FLOT1O75955 427 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP6V1G2O95670 118 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMEP08473 750 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOD2Q9HC29 1040 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.27■■□□□ 1.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCP11Q8WWU5 503 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPFIA2O75334 1257 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP11B2P19099 503 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGEC3Q8TD91 643 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 HES6Q96HZ4 224 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 TXLNGYQ9BZA5 131 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SWAP70Q9UH65 585 aa24.26■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEPT2Q15019 361 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARSHQ5FYA8 562 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCAF12L1Q5VU92 463 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC34Q8IZ02 419 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 BAG3O95817 575 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAT3P40763 770 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GALCP54803 685 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 TLDC1Q6P9B6 456 aa24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLTAP09496 248 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GHRP10912 638 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAX7P23759 505 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLTPP55058 493 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 NENFQ9UMX5 172 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GFPT2O94808 682 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GGT7Q9UJ14 662 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNX24Q9Y343 169 aa24.24■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 AKAP3O75969 853 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC8A1P32418 973 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 HOXD13P35453 343 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 AZI2Q9H6S1 392 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SIX2Q9NPC8 291 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCB4P21439 1286 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRKCIP41743 596 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CASP4P49662 377 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMFRQ9UKV5 643 aa24.23■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPHA7Q15375 998 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 AADACL2Q6P093 401 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 L3MBTL1Q9Y468 752 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEFA5A3E0 1075 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEIP0CG38 1075 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFNAR2P48551 515 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 DR1Q01658 176 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEGQ6S5H5 508 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 P3H4Q92791 437 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CUL5Q93034 780 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CENPTQ96BT3 561 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.22■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 MED24O75448 989 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms