RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 CDC23Q9UJX2 597 aa20.32■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 LCA5LO95447 670 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 SFNP31947 248 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 JAK3P52333 1124 aa20.31■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.31■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 TIPINQ9BVW5 301 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.31■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.31■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 CEP112Q8N8E3 955 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 RDM1Q8NG50 284 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 FIZ1Q96SL8 496 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 DEF6Q9H4E7 631 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.31■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 SFI1A8K8P3 1242 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 MAFGO15525 162 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 PADI6Q6TGC4 694 aa20.3■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.3■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 TGFB1I1O43294 461 aa20.29■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 NOL4O94818 638 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 KIF11P52732 1056 aa20.29■□□□□ 0.84
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HCLS1-201ENST00000314583 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 WDR64B1ANS9 1081 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 HIP1RO75146 1068 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 AKAP3O75969 853 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 ABL1P00519 1130 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 EPHX2P34913 555 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 KIF5AQ12840 1032 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 NLRX1Q86UT6 975 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 C4orf19Q8IY42 314 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 CDCA5Q96FF9 252 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.29■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 MAPK7Q13164 816 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 GOLGA1Q92805 767 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 GANQ9H2C0 597 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 SCN4AP35499 1836 aa20.28■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 AKR1B10O60218 316 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 SERPING1P05155 500 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 RARRES1P49788 294 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 MYBPC2Q14324 1141 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 ACAD9Q9H845 621 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 PPP1R37O75864 691 aa20.27■□□□□ 0.84
HCLS1-201ENST00000314583 STAM2O75886 525 aa20.27■□□□□ 0.84
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