RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 WDR18Q9BV38 432 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 SHTN1A0MZ66 631 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CLSTN1O94985 981 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ACTN1P12814 892 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CHRNA5P30532 468 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ECE1P42892 770 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 TPH2Q8IWU9 490 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 MYCT1Q8N699 235 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 YDJCA8MPS7 323 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 GAS7O60861 476 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 GFPT2O94808 682 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CAPN2P17655 700 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 NNTQ13423 1086 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CEP55Q53EZ4 464 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 IFT20Q8IY31 132 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 DYDC2Q96IM9 177 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6BA6NDN3 693 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 TGFB1I1O43294 461 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 PHACTR2O75167 634 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RPS6KA5O75582 802 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 TAF4BQ92750 862 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 CAVIN3Q969G5 261 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 INTUQ9ULD6 942 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF131P52739 623 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 JAM2P57087 298 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ACER1Q8TDN7 264 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 BORCS6Q96GS4 357 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 VCPKMTQ9H867 229 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 GCNT4Q9P109 453 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 NAGPAQ9UK23 515 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D12O60347 775 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 IVLP07476 585 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FERP16591 822 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 DLGAP5Q15398 846 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.011e-8■■■□□ 17.8
SPNS1-201ENST00000311008 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 NEK9Q8TD19 979 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FTCDO95954 541 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 GGCXP38435 758 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 CASP4P49662 377 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ALS2CLQ60I27 953 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 PBKQ96KB5 322 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 SIX2Q9NPC8 291 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FEM1BQ9UK73 627 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 CLIC2O15247 247 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 RPS6KA1Q15418 735 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC174Q6PII3 467 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 OGFOD1Q8N543 542 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 STAT1P42224 750 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 SLC7A5Q01650 507 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 MS4A14Q96JA4 679 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 GDF3Q9NR23 364 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 EHD2Q9NZN4 543 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 CHMP2AO43633 222 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 OPA1O60313 960 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 TNNC1P63316 161 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 PPP2R5AQ15172 486 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 RIT2Q99578 217 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 NENFQ9UMX5 172 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.36■■□□□ 1.01
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