RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF558Q96NG5 402 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 APOL5Q9BWW9 433 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.04□□□□□ -0.96
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PGGT1B-201ENST00000296642 USP34Q70CQ2 3546 aa9.04□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.04□□□□□ -0.96
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.03□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
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PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.03□□□□□ -0.96
PGGT1B-201ENST00000296642 POMKQ9H5K3 350 aa9.03□□□□□ -0.96
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PGGT1B-201ENST00000296642 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.03□□□□□ -0.96
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PGGT1B-201ENST00000296642 HIP1O00291 1037 aa9.02□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 OPLAHO14841 1288 aa9.02□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 EOMESO95936 686 aa9.02□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 INSRRP14616 1297 aa9.02□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
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PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.02□□□□□ -0.97
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PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.01□□□□□ -0.97
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PGGT1B-201ENST00000296642 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.01□□□□□ -0.97
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PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.01□□□□□ -0.97
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PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.01□□□□□ -0.97
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PGGT1B-201ENST00000296642 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.01□□□□□ -0.97
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PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP54Q96N23 3096 aa9.01□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 SPTBN4Q9H254 2564 aa9□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 KINO60870 393 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 ASGR2P07307 311 aa9□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF5BP33176 963 aa9□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 GATMP50440 423 aa9□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 STAT5BP51692 787 aa9□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9□□□□□ -0.97
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