RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 AZI2Q9H6S1 392 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 ZNF292O60281 2723 aa11.96□□□□□ -0.49
USP41-201ENST00000292729 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 HIDE1A8MVS5 230 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 C9IYK1 514 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 GPR182O15218 404 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 HOXA2O43364 376 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CYTH3O43739 400 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 RPS6KA5O75582 802 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 PDE4AP27815 886 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 APOBRQ0VD83 1088 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ANGPT1Q15389 498 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TMEM266Q2M3C6 531 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TMC7Q7Z402 723 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 FLCNQ8NFG4 579 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 RILPL2Q969X0 211 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 RMDN1Q96DB5 314 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ADAM2Q99965 735 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.95□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 MGEA5O60502 916 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ASGR2P07307 311 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 FAM189BP81408 668 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 MTMR1Q13613 665 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ZNF558Q96NG5 402 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SMOC2Q9H3U7 446 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CYP26B1Q9NR63 512 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ERICH2A1L162 156 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 HIP1O00291 1037 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 MEIS2O14770 477 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ITGB5P18084 799 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SLC26A2P50443 739 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 STAT5BP51692 787 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 PLCB4Q15147 1175 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 LRRC43Q8N309 656 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DTWD2Q8NBA8 298 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 PCYT2Q99447 389 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 JADE2Q9NQC1 790 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SPG21Q9NZD8 308 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 HCSTQ9UBK5 93 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CDH22Q9UJ99 828 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.93□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 PI15O43692 258 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 EOMESO95936 686 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 FGFR1P11362 822 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 NPR3P17342 541 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 SMARCA1P28370 1054 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TROAPQ12815 778 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TRDNQ13061 729 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TDGQ13569 410 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 GIT2Q14161 759 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CYB5R4Q7L1T6 521 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 ABI1Q8IZP0 508 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 GINS2Q9Y248 185 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 COL1A2P08123 1366 aa11.92□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 NFASCO94856 1347 aa11.91□□□□□ -0.5
USP41-201ENST00000292729 CARNS1A5YM72 827 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms