RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfap53Q9D439 514 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7086A0A1W2P766 342 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpmp5E9PXN1 296 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Surf1P09925 306 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prmt6Q6NZB1 378 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rasal3Q8C2K5 1041 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam205aA2APU8 1308 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gna14P30677 355 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 DeptorQ570Y9 409 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ovgp1Q62010 721 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ctnna3Q65CL1 895 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 N4bp3Q8C7U1 537 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bbs7Q8K2G4 715 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wrap53Q8VC51 532 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab3il1Q8VDV3 383 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndst4Q9EQW8 872 aa12.92□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mdm4O35618 489 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cln3Q61124 438 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rcor2Q8C796 523 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr3fQ921X6 316 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adgrf4Q9D2L6 698 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wfdc16A2A5H4 111 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttll10A4Q9F3 704 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prl2c2P04095 224 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nucb2P81117 420 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pou2f2Q00196 463 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tpd52Q62393 224 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nacc1Q7TSZ8 514 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf40bQ80W14 870 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map1sQ8C052 973 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Emc2Q9CRD2 297 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Otud7bB2RUR8 840 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01734 135 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf157Q3TEL6 685 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Specc1Q5SXY1 1067 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bag1Q60739 355 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxn1Q61575 648 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnf1Q7TSH7 493 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 GanQ8CA72 597 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scyl2Q8CFE4 930 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grin3bQ91ZU9 1003 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbx20Q9ES03 445 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 PolkQ9QUG2 852 aa12.91□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd70O55237 195 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtco1P00397 514 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Capn13Q3UW68 665 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nim1kQ8BHI9 436 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-Q4Q8HWB2 354 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc14Q8K2J4 934 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr397Q8VEZ6 315 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dicer1Q8R418 1916 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim5E9PV98 497 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Svs3aF2Z472 265 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nploc4P60670 608 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcerg1lQ3B807 590 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adamts18Q4VC17 1219 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf280dQ68FE8 974 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Med15Q924H2 789 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pidd1Q9ERV7 915 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ercc4Q9QZD4 917 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Skint7A7XV04 395 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmc4P54775 418 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Etaa1Q5SVT3 877 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam214aQ69ZK7 1075 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acot5Q6Q2Z6 421 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp20Q8C6M1 916 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 MafaQ8CF90 359 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc14a1Q8VHL0 384 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hdhd5Q91WM2 419 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tlcd1Q99JT6 247 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 CutaQ9CQ89 177 aa12.9□□□□□ -0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klhdc7aA2APT9 773 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 MafbP54841 323 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf827Q505G8 1078 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snx29Q9D3S3 818 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpm7Q923J1 1863 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magea10A2AMW4 325 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 GclmO09172 274 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 EregQ61521 162 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msantd2Q6NZR2 559 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc169Q8BXX9 214 aa12.89□□□□□ -0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8C5C9 218 aa12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.5 ms