RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hps5P59438 1126 aa25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr5P61965 334 aa25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col9a2Q07643 688 aa25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem199Q5SYH2 208 aa25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adcy3Q8VHH7 1145 aa25.4■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm21969J3QJZ1 289 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r53L7N473 806 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PparaP23204 468 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MafP54843 370 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam198aQ3UY90 562 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ntan1Q64311 310 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ush1gQ80T11 461 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dis3lQ8C0S1 1053 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eml3Q8VC03 897 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q922R1 422 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab30Q923S9 203 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clp1Q99LI9 425 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem206Q9D771 350 aa25.39■■□□□ 1.66
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IppP28575 584 aa25.38■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpc6Q61143 930 aa25.38■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EtnpplQ8BWU8 499 aa25.38■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stx6Q9JKK1 255 aa25.38■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Per1O35973 1291 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Casp7P97864 303 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mark2Q05512 776 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bpifa6Q0VGU8 367 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mier3Q3UHF3 551 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp7b1Q60991 507 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acot5Q6Q2Z6 421 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PodnQ7TQ62 611 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp317Q8C0Q5 607 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc15a5Q8CBB2 566 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snrnp35Q9D384 244 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PrelpQ9JK53 378 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kank3Q9Z1P7 791 aa25.37■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GclmO09172 274 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cer1O55233 272 aa25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gfpt1P47856 697 aa25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snx27Q3UHD6 539 aa25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ago3Q8CJF9 860 aa25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vwa1Q8R2Z5 415 aa25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Calml3Q9D6P8 149 aa25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa25.36■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 March9Q3TZ87 348 aa25.35■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LbpQ61805 481 aa25.35■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ChpfQ6IQX7 774 aa25.35■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc2a12Q8BFW9 622 aa25.35■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prrg2Q8R182 198 aa25.35■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gdpd2Q9ESM6 539 aa25.35■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa25.34■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defb25Q30KN8 71 aa25.34■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa25.34■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Leo1Q5XJE5 667 aa25.34■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim37Q6PCX9 961 aa25.34■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asnsd1Q8BFS9 627 aa25.34■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc46Q9DAP0 323 aa25.34■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc16a6B1AT66 607 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psmc2P46471 433 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccr5P51682 354 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RabggtbP53612 339 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Drp2Q05AA6 957 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm28047Q3US59 414 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtss1lQ6P9S0 715 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stoml1Q8CI66 399 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 OtoaQ8K561 1137 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr395Q8VGR3 312 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Emc2Q9CRD2 297 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rab27aQ9ERI2 221 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc15a2Q9ES07 729 aa25.33■■□□□ 1.65
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm11985A0A1B0GS61 206 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5134E9QAB5 671 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdelc2G5E897 503 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina1aP07758 413 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina1bP22599 413 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnni3P48787 211 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TdgP56581 421 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina1cQ00896 412 aa25.32■■□□□ 1.64
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina1dQ00897 413 aa25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.5 ms