RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C SWH1P35845 1188 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C MRPL16P38064 232 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RFC4P40339 323 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C POP1P41812 875 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C MEP2P41948 499 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ADO1P47143 340 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YJR154WP47181 346 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C AIF1P52923 378 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C EFM5P53200 248 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YGR053CP53234 283 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RHO5P53879 331 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C CRZ1P53968 678 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C PRM15Q03262 622 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YMR209CQ03648 457 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YMR155WQ03795 547 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ECI1Q05871 280 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C VPS38Q05919 439 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YET3Q07451 203 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C GAT3Q07928 141 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C CSI2Q08054 341 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C BSC1Q12140 328 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C FRE8Q12209 686 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C NPC2Q12408 173 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RHO1P06780 209 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C NGG1P32494 702 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C PPG1P32838 368 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C FAA2P39518 744 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C YJL193WP39542 402 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SEC28P40509 296 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C FMP32P43557 207 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C PTR3P43606 678 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C NIT2P47016 307 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C AIM22P47051 409 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C AAD10P47182 288 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RNH70P53331 553 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SWP1Q02795 286 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C YPL039WQ03080 316 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RSN1Q03516 953 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C HPT1Q04178 221 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C FDH1Q08911 376 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C UIP4Q08926 304 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C YIG1Q08956 461 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SRL2Q12020 392 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C ATG34Q12292 412 aa3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RIB2Q12362 591 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C MSI1P13712 422 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
SUP53tL(CAA)C HEM15P16622 393 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C AMD2P22580 549 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C PBN1P25580 416 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C YCR090CP25654 182 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C EHD3P28817 500 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SSO1P32867 290 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C VPS21P36017 210 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C COS9P36034 407 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C ETR1P38071 380 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C AIM3P38266 947 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C STP2P38704 541 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C REV7P38927 245 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C YER084WP40057 128 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SCS2P40075 244 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C MPH1P40562 993 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C GLR1P41921 483 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C ABM1P47146 123 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C PPT1P53043 513 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C LSG1P53145 640 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SLT2Q00772 484 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C KAP120Q02932 1032 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C EKI1Q03764 534 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RIM13Q03792 727 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C URH1Q04179 340 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C YMR317WQ04893 1140 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C COX20Q04935 205 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C TPO3Q06451 622 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C GRE1Q08969 168 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C APC9Q12107 265 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C MED2Q12124 431 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SLP1Q12232 587 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C KCS1Q12494 1050 aa3.26□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RPS5P26783 225 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C MNS1P32906 549 aa3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RPT5P33297 434 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C MFT1P33441 392 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C SOF1P33750 489 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C STO1P34160 861 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C PTH2P34222 208 aa3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C YNK1P36010 153 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C RPC37P36121 282 aa3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C MRPL10P36520 322 aa3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SUP53tL(CAA)C FLO5P38894 1075 aa3.25□□□□□ -1.89
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