RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	COX5A	P00424	153 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
MRP4	YHL004W	ADH7	P25377	361 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PEX34	P25584	144 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	BUD14	P27637	709 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	KRE6	P32486	720 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	KAR9	P32526	644 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RML2	P32611	393 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	TUL1	P36096	758 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MRP21	P38175	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
MRP4	YHL004W	YBR032W	P38223	100 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YJL193W	P39542	402 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YNL195C	P40168	261 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PEP8	P40335	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MOB1	P40484	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YGL114W	P53134	725 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	COQ6	P53318	479 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	BIO4	P53630	237 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	IPI3	P53877	555 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RRN11	Q04712	507 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HOF1	Q05080	669 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	BOP2	Q06150	570 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RSR1	P13856	272 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CLN1	P20437	546 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	VPS33	P20795	691 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	VPS34	P22543	875 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PPH22	P23595	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PEX1	P24004	1043 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YSP3	P25036	478 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PHA2	P32452	334 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CYM1	P32898	989 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MSN4	P33749	630 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ARA1	P38115	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	THI2	P38141	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YBR062C	P38239	180 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	EHT1	P38295	451 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YHR112C	P38716	378 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	FMO1	P38866	432 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	FAD1	P38913	306 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
MRP4	YHL004W	PET100	P38958	111 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ECM1	P39715	212 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	EXO1	P39875	702 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YFL012W	P43580	148 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	FAR3	P46671	204 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	EFM3	P47163	339 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PET117	Q02771	107 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ACL4	Q03771	387 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SPC24	Q04477	213 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ULA1	Q12059	462 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RLM1	Q12224	676 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	OCA6	Q12454	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	VPS63	O13549	108 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	STE3	P06783	470 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MRPL8	P22353	238 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GSH1	P32477	678 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RIM2	P38127	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RFC3	P38629	340 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YHI9	P38765	294 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YHR182W	P38870	785 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SEO1	P39709	593 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HAT2	P39984	401 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	BUR6	P40096	142 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	IAH1	P41734	238 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YDL183C	P48569	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	DIA3	P52290	468 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	COS12	P53053	380 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	NUP100	Q02629	959 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	NHP10	Q03435	203 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SLD7	Q08457	257 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PEX11	Q12462	236 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.3 ms