RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W PHO13P19881 312 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PRE8P23639 250 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RBK1P25332 333 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W DCC1P25559 380 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CSM1P25651 190 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PHO91P27514 894 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W LAC1P28496 418 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YIM1P28625 365 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PEX3P28795 441 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YOX1P34161 385 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ETR1P38071 380 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PFF1P38244 976 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SHG1P38337 142 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PCM1P38628 557 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RMD6P39975 231 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YER085CP40058 173 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CFD1P40558 293 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CIN1P40987 1014 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W IDP2P41939 412 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SHY1P53266 389 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ATP23P53722 227 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YNR062CP53748 327 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SAE3P89114 91 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YSA1Q01976 231 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YDR541CQ03049 344 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PRM15Q03262 622 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YEH1Q07804 573 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RFU1Q08003 200 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CTI6Q08923 506 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CSM4Q08955 156 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YPR063CQ12160 140 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YOR114WQ12219 294 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W INP53Q12271 1107 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PSY3Q12318 242 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SNF8Q12483 233 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W RGS2Q99188 309 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W YPT6Q99260 215 aa3.28□□□□□ -1.88
VFA1YER128W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W QCR2P07257 368 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W NFT1P0CE68 1218 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W COS2P0CX12 379 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W COS3P0CX13 379 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FRS2P15625 503 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SNF6P18888 332 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DBR1P24309 405 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RNA14P25298 677 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W STE50P25344 346 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RRT12P25381 491 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RSA4P25382 515 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PRE4P30657 266 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SAC1P32368 623 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W LHP1P33399 275 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SOF1P33750 489 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SRB2P34162 210 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRPL3P36516 390 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FMP23P38231 175 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YBR062CP38239 180 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W AME1P38313 324 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W COS8P38723 381 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YHL041WP38730 149 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CYC2P38909 366 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MNN9P39107 395 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W UIP3P39547 235 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W GDH3P39708 457 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ACA1P39970 489 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W GPP2P40106 250 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W UBP7P40453 1071 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DOT5P40553 215 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W AGP3P43548 558 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SAD1P43589 448 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W IRC5P43610 853 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W IRC7P43623 340 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YAR1P46683 200 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W HLJ1P48353 224 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YPT32P51996 222 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PKP2P53170 491 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W VPS75P53853 264 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MTQ1P53944 314 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MSC1Q03104 513 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W TRM82Q03774 444 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RSF1Q05043 376 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MSC3Q05812 728 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W NEJ1Q06148 342 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W COS7Q07788 383 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W LDB18Q07887 179 aa3.27□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PEX15Q08215 383 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.1 ms