RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	DNM3	Q9UQ16	869 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRM	P28827	1452 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		6.02	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616		F5H423	210 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA12	O60330	932 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RBP3	P10745	1247 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SSTR4	P31391	388 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	AK2	P54819	239 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	BIRC3	Q13489	604 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ICE2	Q659A1	982 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF18B	Q86Y91	864 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	BVES	Q8NE79	360 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	POF1B	Q8WVV4	589 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SKA1	Q96BD8	255 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	EMC7	Q9NPA0	242 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MADD	Q8WXG6	1647 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616		E9PCH4	1651 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616		B4E1Z4	1266 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CBX4	O00257	560 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PAX4	O43316	350 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP152	O94986	1710 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CRTAM	O95727	393 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RHCE	P18577	417 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CD97	P48960	835 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT85	P78386	507 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	HTRA3	P83110	453 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	RHD	Q02161	417 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PLA2R1	Q13018	1463 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TAAR9	Q96RI9	348 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MYD88	Q99836	296 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRP1	Q9C000	1473 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	C3	P01024	1663 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVK-7	P63135	1459 aa		6	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	COPB2	P35606	906 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CLCN7	P51798	805 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	IDI1	Q13907	227 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MYBPC2	Q14324	1141 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	LONRF1	Q17RB8	773 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	HYI	Q5T013	277 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	DCAF15	Q66K64	600 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC89	Q8N998	374 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPM2	O94759	1503 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	IL33	O95760	270 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SRF	P11831	508 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SPINK2	P20155	84 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	LSS	P48449	732 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	GPSM2	P81274	684 aa		5.99	□□□□□ -1.45
EFHC1-223	ENST00000636616	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms