RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN5P54829 565 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 COASYQ13057 564 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PHOX2BQ99453 314 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 TLE6Q9H808 572 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 JADE2Q9NQC1 790 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A2Q9UBY0 812 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCA1P28370 1054 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC6Q8TAG9 804 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PCYT2Q99447 389 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA6Q9UN73 950 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC69A6NI79 296 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMLP26374 656 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 ZXDAP98168 799 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM266Q2M3C6 531 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 GINS2Q9Y248 185 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC3P53804 2025 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 KAT6AQ92794 2004 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC730098B7Z3J9 87 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RXRAP19793 462 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCB4Q15147 1175 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 IER5LQ5T953 404 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 CRIPAKQ8N1N5 446 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SDF4Q9BRK5 362 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF318Q5VUA4 2279 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 MAFGO15525 162 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PRC1O43663 620 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 GLP2RO95838 553 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT76Q01546 638 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PKN1Q16512 942 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 AAASQ9NRG9 546 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PER2O15055 1255 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC82Q8N4S0 544 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRX2Q99811 253 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TBKBP1A7MCY6 615 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TECTAO75443 2155 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE4AP27815 886 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SARSP49591 514 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 STAT5BP51692 787 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTR2P61160 394 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TMX1Q9H3N1 280 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND3A2RUS2 1198 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 THNSL1Q8IYQ7 743 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL6Q8N531 539 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TLR9Q9NR96 1032 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNH7Q9NS40 1196 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
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CAPNS1-217ENST00000629983 CALM1P0DP23 149 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 CALM2P0DP24 149 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 CALM3P0DP25 149 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
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CAPNS1-217ENST00000629983 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TMTC2Q8N394 836 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 NME8Q8N427 588 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 MXRA8Q9BRK3 442 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
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CAPNS1-217ENST00000629983 MGEA5O60502 916 aa31.23■■■□□ 2.59
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB33Q86T24 672 aa31.23■■■□□ 2.59
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CAPNS1-217ENST00000629983 MAP4K1Q92918 833 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PGBD1Q96JS3 809 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM87BQ96K49 555 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 MTA3Q9BTC8 594 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-5Q9HDB9 667 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM260Q9NX78 707 aa31.23■■■□□ 2.59
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