RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-215	ENST00000626257	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMX2	Q9Y320	296 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	GCNT3	O95395	438 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	NAB2	Q15742	525 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCDC181	Q5TID7	509 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	EHD2	Q9NZN4	543 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	CLRN2	A0PK11	232 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	NR3C1	P04150	777 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRAF1	Q13077	416 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	MED4	Q9NPJ6	270 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		28.92	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	SPDYE6	P0CI01	402 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	KLRC1	P26715	233 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCDC174	Q6PII3	467 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	GOPC	Q9HD26	462 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	TSKS	Q9UJT2	592 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	KCNA1	Q09470	495 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	SFI1	A8K8P3	1242 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	PALM	O75781	387 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	PSMD10	O75832	226 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	UCHL3	P15374	230 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	PON1	P27169	355 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	PAFAH1B1	P43034	410 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	HINFP	Q9BQA5	517 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLITRK3	O94933	977 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	POLR2M	P0CAP2	368 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	POLD1	P28340	1107 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	CASP4	P49662	377 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	TPH2	Q8IWU9	490 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	DYDC2	Q96IM9	177 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHMP2A	O43633	222 aa		28.89	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	GAP43	P17677	238 aa		28.89	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		28.89	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		28.89	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		28.89	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	CLIC2	O15247	247 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	C21orf2	O43822	256 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	PHACTR2	O75167	634 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	LMAN1	P49257	510 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	PPP2R5C	Q13362	524 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLC5A5	Q92911	643 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	SPAG5	Q96R06	1193 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	UBXN2A	P68543	259 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	PTK2	Q05397	1052 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	EPHA7	Q15375	998 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	FAM151A	Q8WW52	585 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	RUBCN	Q92622	972 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	FAM13A	O94988	1023 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	TAF3	Q5VWG9	929 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLC35C1	Q96A29	364 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	MS4A14	Q96JA4	679 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	TGFB1I1	O43294	461 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZBTB39	O15060	712 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	FTCD	O95954	541 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	MYCT1	Q8N699	235 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CCZ1B-215	ENST00000626257	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21

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