RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	DLL1	O00548	723 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	HBP1	O60381	514 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	IER5	Q5VY09	327 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SEMA3B-215	ENST00000621029	MSH4	O15457	936 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	UPP2	O95045	317 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	NEK4	P51957	841 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	MGAT3	Q09327	533 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	LENG9	Q96B70	501 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	GAS7	O60861	476 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEC24B	O95487	1268 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	KLRC1	P26715	233 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	LPIN1	Q14693	890 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	NECAB1	Q8N987	351 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	INSL6	Q9Y581	213 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	STK36	Q9NRP7	1315 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	WDR64	B1ANS9	1081 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	CHMP2A	O43633	222 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	TDP2	O95551	362 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPRED2	Q7Z698	418 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	WASF1	Q92558	559 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	YME1L1	Q96TA2	773 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	RIT2	Q99578	217 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	EPOP	A6NHQ4	379 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	EDIL3	O43854	480 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	DISC1	Q9NRI5	854 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029		M0R2N6	131 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	NPY5R	Q15761	445 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	INF2	Q27J81	1249 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	NME8	Q8N427	588 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC5A5	Q92911	643 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	GJA10	Q969M2	543 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	GINS2	Q9Y248	185 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL1A2	P08123	1366 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SEMA3B-215	ENST00000621029	LINC01553	A4QN01	128 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	CTDNEP1	O95476	244 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP4A	P20648	1035 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	ME3	Q16798	604 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029		Q4G0T1	1027 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	TOP1MT	Q969P6	601 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	IL17RA	Q96F46	866 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPRS	Q13332	1948 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	EYS	Q5T1H1	3165 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	CD52	P31358	61 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	LETM2	Q2VYF4	491 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	GTF3C6	Q969F1	213 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029		A0A0C4DFX4	3053 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	LARGE1	O95461	756 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	JAK3	P52333	1124 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	METTL13	Q8N6R0	699 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM167A	Q96KS9	214 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP3A7	P24462	503 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	SFN	P31947	248 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	GRB10	Q13322	594 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	ERVK-21	P61565	698 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	PAK2	Q13177	524 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		32.71	■■■□□ 2.83

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