RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598913.5

SAMD4B-208, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD4B, Length 2,877 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4B-208ENST00000598913 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.88■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 DNM3Q9UQ16 869 aa24.88■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 OPLAHO14841 1288 aa24.88■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.88■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 SP8Q8IXZ3 490 aa24.88■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 RUFY1Q96T51 708 aa24.88■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 BACH1O14867 736 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 TRIM49P0CI25 452 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 TRIM49CP0CI26 452 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 LLGL1Q15334 1064 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 RASSF4Q9H2L5 321 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ZNF233A6NK53 670 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 RGL2O15211 777 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 GUCY1A3Q02108 690 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 SEMA3FQ13275 785 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 TISP43B9A030 160 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CYP2J2P51589 502 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 FLT3P36888 993 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 EPHB4P54760 987 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CERS3Q8IU89 383 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 BANK1Q8NDB2 785 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 GCNT4Q9P109 453 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 SWAP70Q9UH65 585 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 MYH4Q9Y623 1939 aa24.86■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 HSF2BPO75031 334 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 NR3C1P04150 777 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 HPDP32754 393 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CEP63Q96MT8 703 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 NR2E1Q9Y466 385 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ASTN1O14525 1302 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 IVLP07476 585 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 NNTQ13423 1086 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 FBXO11Q86XK2 927 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.85■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 PRLRP16471 622 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ERVK-9P63128 1117 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ACER1Q8TDN7 264 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CLRN2A0PK11 232 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 PALB2Q86YC2 1186 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 MYCT1Q8N699 235 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 NAGPAQ9UK23 515 aa24.84■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 RPS6KA1Q15418 735 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 HYIQ5T013 277 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 DYDC2Q96IM9 177 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 SEC24CP53992 1094 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 CFAP58Q5T655 872 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 AMNQ9BXJ7 453 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 AMACRQ9UHK6 382 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 GRIN2DO15399 1336 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 ABCB11O95342 1321 aa24.83■■□□□ 1.57
SAMD4B-208ENST00000598913 PPFIA4O75335 1185 aa24.83■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 LIG3P49916 1009 aa24.83■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.83■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 AADACL2Q6P093 401 aa24.83■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 AFF2P51816 1311 aa24.82■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.82■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 CHADLQ6NUI6 762 aa24.82■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 METTL13Q8N6R0 699 aa24.82■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 SLC35C1Q96A29 364 aa24.82■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SAMD4B-208ENST00000598913 WDR18Q9BV38 432 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms