RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ECM1Q16610 540 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PDILTQ8N807 584 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 DNERQ8NFT8 737 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 STAMQ92783 540 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC5A5Q92911 643 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 APBA2Q99767 749 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TINF2Q9BSI4 451 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 VAV3Q9UKW4 847 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM17Q9Y577 477 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.8□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM150BA6NC51 233 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB39O15060 712 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GAS7O60861 476 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CUTAO60888 179 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP6R2O75170 966 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MED24O75448 989 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMD10O75832 226 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GGPS1O95749 300 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PFKFB1P16118 471 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CASP1P29466 404 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA8P51970 172 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 LBX1P52954 281 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCB2Q00722 1185 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP4A11Q02928 519 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 UGCGQ16739 394 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MCTP2Q6DN12 878 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNK18Q7Z418 384 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRX1Q86UT6 975 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 BANK1Q8NDB2 785 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MORC4Q8TE76 937 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ERO1AQ96HE7 468 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 DYDC2Q96IM9 177 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PNMA5Q96PV4 448 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 IWS1Q96ST2 819 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 RGL1Q9NZL6 768 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SRRDQ9UH36 339 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 MYADML2A6NDP7 307 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB14A6NK59 587 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCY3O60266 1144 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXC6P09630 235 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 BMP2P12643 396 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CNGA1P29973 690 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ICAM3P32942 547 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMC6P62333 389 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 BEX3Q00994 111 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT76Q01546 638 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 GRB10Q13322 594 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 ACVR2BQ13705 512 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CAMK4Q16566 473 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRNQ16849 979 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-208ENST00000589162 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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