RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.94■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 STBD1O95210 358 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 TINF2Q9BSI4 451 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC39A2Q9NP94 309 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC5A4Q9NY91 659 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF35A5YM69 484 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 TTLL4Q14679 1199 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 TXNP10599 105 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 CTGFP29279 349 aa28.92■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PAK1Q13153 545 aa28.92■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ANO5Q75V66 913 aa28.92■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKEF1Q9NU02 776 aa28.92■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 RWDD2AQ9UIY3 292 aa28.92■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 GJD2Q9UKL4 321 aa28.92■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 MGAMO43451 1857 aa28.92■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM150BA6NC51 233 aa28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM26FQ5R3K3 315 aa28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 SARM1Q6SZW1 724 aa28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PDLIM2Q96JY6 352 aa28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 FANCLQ9NW38 375 aa28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 RSPH10BP0C881 870 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 GUCY2CP25092 1073 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 STX17P56962 302 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PADI6Q6TGC4 694 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 NELFBQ8WX92 580 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PLCB2Q00722 1185 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 STIM1Q13586 685 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 GLIS3Q8NEA6 775 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 COPS5Q92905 334 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PCYT2Q99447 389 aa28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PCNTO95613 3336 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ARID2Q68CP9 1835 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 BACH1O14867 736 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ADCY5O95622 1261 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R2P41236 205 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PRKCEQ02156 737 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA1Q5VX52 437 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R9BQ96SB3 815 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR20Q99678 358 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF302Q9NR11 478 aa28.89■■■□□ 2.22
SCAMP4-210ENST00000588555 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 PSMA7O14818 248 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP4AP20648 1035 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF131P52739 623 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TPM4P67936 248 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 PLA2G4FQ68DD2 849 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 FLRT1Q9NZU1 646 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ODF2LQ9ULJ1 636 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF18P17022 549 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SFR1Q86XK3 245 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 POLD4Q9HCU8 107 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa28.88■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TBCAO75347 108 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 IGHA2P01877 340 aa28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP1A3P13637 1013 aa28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 PMS1P54277 932 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 NPEPPSP55786 919 aa28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC173Q0VFZ6 552 aa28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPK7Q13164 816 aa28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 PTGS1P23219 599 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 RGS2P41220 211 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ADCYAP1R1P41586 468 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP1Q07960 439 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ACVR2BQ13705 512 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 XKR9Q5GH70 373 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 XKR3Q5GH77 459 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 OTUD6AQ7L8S5 288 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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