RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 AZI2Q9H6S1 392 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 TSKSQ9UJT2 592 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 Q9Y3F1 56 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 LGR5O75473 907 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 HMGCRP04035 888 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC192P0DO97 292 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 SLC12A3P55017 1021 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 CUL4BQ13620 913 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 GPBP1Q86WP2 473 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 SPATA20Q8TB22 786 aa20.17■□□□□ 0.82
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SPNS2-202ENST00000570641 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 GSDMAQ96QA5 445 aa20.17■□□□□ 0.82
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SPNS2-202ENST00000570641 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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SPNS2-202ENST00000570641 A0A087WWV3 80 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 MYMKA6NI61 221 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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SPNS2-202ENST00000570641 XKR3Q5GH77 459 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 RMND1Q9NWS8 449 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF862O60290 1169 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 ELNP15502 786 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 CYP11B2P19099 503 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 CASP1P29466 404 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 SLC26A2P50443 739 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 ASIC1P78348 528 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 PRKCEQ02156 737 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 TYRO3Q06418 890 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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SPNS2-202ENST00000570641 TRPV1Q8NER1 839 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 AFG1LQ8WV93 481 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 DDX12PQ92771 950 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 FAM167AQ96KS9 214 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPNS2-202ENST00000570641 TSPY26PQ9H489 355 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS2-202ENST00000570641 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPNS2-202ENST00000570641 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 ADCY6O43306 1168 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 PPFIA4O75335 1185 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 OATP04181 439 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 RARRES1P49788 294 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 NLRP12P59046 1061 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 STX1AQ16623 288 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 GLG1Q92896 1179 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 ANO10Q9NW15 660 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 MYH11P35749 1972 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 BIN1O00499 593 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 ZBTB39O15060 712 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 SEPT4O43236 478 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 STBD1O95210 358 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 MMP3P08254 477 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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SPNS2-202ENST00000570641 CNGA1P29973 690 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 KCNB1Q14721 858 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 XKR9Q5GH70 373 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 UNC13DQ70J99 1090 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 DYMQ7RTS9 669 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 ATP4AP20648 1035 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 CPT1AP50416 773 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 TRIM32Q13049 653 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 DGKDQ16760 1214 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 ARSHQ5FYA8 562 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 ANO5Q75V66 913 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS2-202ENST00000570641 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.12■□□□□ 0.81
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