RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.49■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.49■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 FEM1BQ9UK73 627 aa25.49■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 GAS7O60861 476 aa25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 PRLRP16471 622 aa25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 CEP55Q53EZ4 464 aa25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 FAM83AQ86UY5 434 aa25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.48■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 AKAP3O75969 853 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 POLD1P28340 1107 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 LDHDQ86WU2 507 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 CREG2Q8IUH2 290 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 FAM13AO94988 1023 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 DPEP1P16444 411 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 KCNA3P22001 575 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ASIC2Q16515 512 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 SFI1A8K8P3 1242 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ACTN1P12814 892 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 KCNA1Q09470 495 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 IQCEQ6IPM2 695 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 NOX5Q96PH1 765 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB39O15060 712 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ARP10275 920 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 SLC9A1P19634 815 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 COG1Q8WTW3 980 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 OSBPL9Q96SU4 736 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.45■■□□□ 1.67
EHD4-202ENST00000569223 H3BQF6 201 aa25.45■■□□□ 1.66
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EHD4-202ENST00000569223 MUTP22033 750 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 MCM3P25205 808 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 CASP4P49662 377 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
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EHD4-202ENST00000569223 C2orf54Q08AI8 447 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 KLHL30Q0D2K2 578 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 SLC18A3Q16572 532 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 MYCT1Q8N699 235 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.45■■□□□ 1.66
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EHD4-202ENST00000569223 CLIC2O15247 247 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 TGFB1I1O43294 461 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 PTGER2P43116 358 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 NIM1KQ8IY84 436 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 VPS33BQ9H267 617 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 BUB1O43683 1085 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 TCP1P17987 556 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 PON1P27169 355 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 MAP3K10Q02779 954 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 CASP8Q14790 479 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 EPHA7Q15375 998 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 A0A087X0T9 212 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 NCK2O43639 380 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 FAM228BP0C875 321 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 NACC1Q96RE7 527 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 PARVGQ9HBI0 331 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 ASNSP08243 561 aa25.42■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 UCHL3P15374 230 aa25.42■■□□□ 1.66
EHD4-202ENST00000569223 ITIH3Q06033 890 aa25.42■■□□□ 1.66
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