RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL27Q8NEV9 243 aa19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 DBF4BQ8NFT6 615 aa19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 RDM1Q8NG50 284 aa19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 MBOAT7Q96N66 472 aa19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRMS1Q9HCU9 246 aa19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 JAK3P52333 1124 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF484Q5JVG2 852 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRCH2Q5VUJ6 765 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 IER5Q5VY09 327 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 NME8Q8N427 588 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJB3Q8WWF6 145 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM167AQ96KS9 214 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEKT3Q9BXF9 490 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 M0QZ92 97 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TLL1O43897 1013 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRNA1P02708 482 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMHP03971 560 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 FDPSP14324 419 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM25P49756 843 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MGAT3Q09327 533 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 INF2Q27J81 1249 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP4R3AQ6IN85 833 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEK8Q86SG6 692 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP38Q8NB14 1042 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBED2Q9BTP6 218 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 DISC1Q9NRI5 854 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP131Q9UPN4 1083 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAMM50Q9Y512 469 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 SQORQ9Y6N5 450 aa19.32■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMD10O75832 226 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 GJB5O95377 273 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TDP2O95551 362 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 CA3P07451 260 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB103AP81534 67 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCTN1Q2MV58 587 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 CKAP2LQ8IYA6 745 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 UIMC1Q96RL1 719 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAD9AQ99638 391 aa19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MICAL3Q7RTP6 2002 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHD7Q9P2D1 2997 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYOGP15173 224 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLRC1P26715 233 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT2P35908 639 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM29Q14134 588 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 LETM2Q2VYF4 491 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 ETNPPLQ8TBG4 499 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM20AQ96MK3 541 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 GABBR1Q9UBS5 961 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDY2AQ9Y6F7 541 aa19.3■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRSQ13332 1948 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBX3O15119 743 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP4AP20648 1035 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 LPIN1Q14693 890 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO47Q5MNV8 452 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 B3GNT9Q6UX72 402 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF2CQ99661 725 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC45AQ9H3U1 944 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRDM12Q9H4Q4 367 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRBP2Q9NSY0 501 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 GJB4Q9NTQ9 266 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPV2Q9Y5S1 764 aa19.29■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB42B2RXF5 422 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMP1P03956 469 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 GHRP10912 638 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIER3Q7Z3K6 550 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF710Q8N1W2 664 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 OXER1Q8TDS5 423 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNMB3Q9NPA1 279 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 INSL6Q9Y581 213 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRANK1O15050 2925 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIP14410 1827 aa19.28■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGEB2O15479 319 aa19.27■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHMP2AO43633 222 aa19.27■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 JAK2O60674 1132 aa19.27■□□□□ 0.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 OATP04181 439 aa19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms