RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 GPNMBQ14956 572 aa24.37■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.37■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.37■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.37■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.37■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 MTMR9Q96QG7 549 aa24.37■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 ZNF862O60290 1169 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 MCM7P33993 719 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TRAPPC10P48553 1259 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 UGCGQ16739 394 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 RPAINQ86UA6 219 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 COL1A2P08123 1366 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 RSPH10BP0C881 870 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 ZNF174Q15697 407 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TTC38Q5R3I4 469 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 RASIP1Q5U651 963 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 MCTP1Q6DN14 999 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 FAM167AQ96KS9 214 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 SCN5AQ14524 2016 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 NBNO60934 754 aa24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 OATP04181 439 aa24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 MBTPS1Q14703 1052 aa24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 HERVK_113Q902F9 699 aa24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.34■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 CXCL10P02778 98 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 KLRC1P26715 233 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TXKP42681 527 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 PRKCEQ02156 737 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 EPHA7Q15375 998 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 FAM26DQ5JW98 314 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NME3-210ENST00000567271 WDR81Q562E7 1941 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 CTSHP09668 335 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 PSMC5P62195 406 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 RSPH3Q86UC2 560 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 BANK1Q8NDB2 785 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.31■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 STBD1O95210 358 aa24.31■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 NBR1Q14596 966 aa24.31■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 XKR3Q5GH77 459 aa24.31■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 C22orf31O95567 290 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 CHRNA1P02708 482 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 P4HBP07237 508 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 ACTN1P12814 892 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 PDCP20941 246 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 HSCBQ8IWL3 235 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 LRCH3Q96II8 777 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 TET1Q8NFU7 2136 aa24.29■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 OR52Z1P0C646 297 aa24.29■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 MGAT3Q09327 533 aa24.29■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.29■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 NME8Q8N427 588 aa24.29■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.29■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 RGL1Q9NZL6 768 aa24.29■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 MAGEB2O15479 319 aa24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 DYDC2Q96IM9 177 aa24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
NME3-210ENST00000567271 SZT2Q5T011 3432 aa24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms