RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 HBP1O60381 514 aa21.51■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 JAK3P52333 1124 aa21.51■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 MBTPS1Q14703 1052 aa21.51■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.51■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.51■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 POTEDQ86YR6 584 aa21.51■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 ATP4AP20648 1035 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 SFNP31947 248 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 Q7L0L9 218 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 FAM20AQ96MK3 541 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.5■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 CAND2O75155 1236 aa21.49■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 CXCL10P02778 98 aa21.49■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 ATP2B1P20020 1258 aa21.49■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 GPR153Q6NV75 609 aa21.49■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 RSPH3Q86UC2 560 aa21.49■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 PTPRSQ13332 1948 aa21.49■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 SLC34A2O95436 690 aa21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 UGCGQ16739 394 aa21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 DEFB123Q8N688 67 aa21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 KIF3AQ9Y496 699 aa21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 COL1A2P08123 1366 aa21.48■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 WNT7AO00755 349 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 TBX3O15119 743 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 ZNF862O60290 1169 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 KLRC1P26715 233 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 TCTN1Q2MV58 587 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 RDM1Q8NG50 284 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 HAS1Q92839 578 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 FAM167AQ96KS9 214 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 FAM161BQ96MY7 647 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 VAV3Q9UKW4 847 aa21.47■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 CHRNA1P02708 482 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 OATP04181 439 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 DNAJB2P25686 324 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 PBX2P40425 430 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 KCNJ6P48051 423 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 PRKCEQ02156 737 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 CALCRLQ16602 461 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 FAM26DQ5JW98 314 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 RPAINQ86UA6 219 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 PBX4Q9BYU1 374 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.46■■□□□ 1.03
PKD1-232ENST00000566905 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 EML1O00423 815 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 NEMFO60524 1076 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 BAIAP3O94812 1187 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 GJB2P29033 226 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 PPP2R5CQ13362 524 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 BANK1Q8NDB2 785 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.45■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 KIF28PB7ZC32 967 aa21.44■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 MCM7P33993 719 aa21.44■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 RABGGTBP53611 331 aa21.44■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 MGAT3Q09327 533 aa21.44■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 IKBKEQ14164 716 aa21.44■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.44■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.44■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 M0QZ92 97 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 GHRP10912 638 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 IER5Q5VY09 327 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 METTL13Q8N6R0 699 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 SEPT8Q92599 483 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 TIFAQ96CG3 184 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 SLC9A7Q96T83 725 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 MSRAQ9UJ68 235 aa21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PKD1-232ENST00000566905 MYO9BQ13459 2157 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms