RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 RPAINQ86UA6 219 aa21.53■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 POTEDQ86YR6 584 aa21.53■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.53■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 HAS1Q92839 578 aa21.53■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 VAV3Q9UKW4 847 aa21.53■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.53■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 ZNF862O60290 1169 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 ACTN1P12814 892 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 SFNP31947 248 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 PBX2P40425 430 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 MCM2P49736 904 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 UGCGQ16739 394 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 FAM26DQ5JW98 314 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 DEFB123Q8N688 67 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 FAM20AQ96MK3 541 aa21.52■■□□□ 1.04
EDC3-211ENST00000566243 CHRNA1P02708 482 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 MGAT3Q09327 533 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 RDM1Q8NG50 284 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 PBX4Q9BYU1 374 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 SCN5AQ14524 2016 aa21.51■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 EML1O00423 815 aa21.5■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TBX3O15119 743 aa21.5■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 DNAJB2P25686 324 aa21.5■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 KLRC1P26715 233 aa21.5■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.5■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 COL1A2P08123 1366 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 KIF28PB7ZC32 967 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 BAIAP3O94812 1187 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 OATP04181 439 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 PPP2R5CQ13362 524 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 RSPH3Q86UC2 560 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 FAM161BQ96MY7 647 aa21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 C22orf31O95567 290 aa21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 RABGGTBP53611 331 aa21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 PRKCEQ02156 737 aa21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 FAM167AQ96KS9 214 aa21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.48■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 MARCH6O60337 910 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 STBD1O95210 358 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 ATP2B1P20020 1258 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 BANK1Q8NDB2 785 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TIFAQ96CG3 184 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 CDH23Q9H251 3354 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TET1Q8NFU7 2136 aa21.47■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 NEMFO60524 1076 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 GHRP10912 638 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 MYOGP15173 224 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 GJB2P29033 226 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 DEFB103AP81534 67 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 IKBKEQ14164 716 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 LPIN1Q14693 890 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 CALCRLQ16602 461 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 SLC9A7Q96T83 725 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.46■■□□□ 1.03
EDC3-211ENST00000566243 TMEM150BA6NC51 233 aa21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 KCNJ6P48051 423 aa21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 RAB30Q15771 203 aa21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 SEPT8Q92599 483 aa21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 GUCD1Q96NT3 240 aa21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 MTMR9Q96QG7 549 aa21.45■■□□□ 1.02
EDC3-211ENST00000566243 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.45■■□□□ 1.02
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