RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF862	O60290	1169 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	RSPH10B	P0C881	870 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC26A2	P50443	739 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR153	Q6NV75	609 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	POTED	Q86YR6	584 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	HAS1	Q92839	578 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	VAV3	Q9UKW4	847 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	EML1	O00423	815 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	HBP1	O60381	514 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	CHRNA1	P02708	482 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	PBX2	P40425	430 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	DEFB123	Q8N688	67 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM20A	Q96MK3	541 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	KIF28P	B7ZC32	967 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	CAND2	O75155	1236 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	ACTN1	P12814	892 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	KLRC1	P26715	233 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	SFN	P31947	248 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MCM2	P49736	904 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	JAK3	P52333	1124 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	RABGGTB	P53611	331 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKCE	Q02156	737 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MGAT3	Q09327	533 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	PPP2R5C	Q13362	524 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM26D	Q5JW98	314 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	RPAIN	Q86UA6	219 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	IL27	Q8NEV9	243 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	RDM1	Q8NG50	284 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM161B	Q96MY7	647 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	PBX4	Q9BYU1	374 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		12.68	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM150B	A6NC51	233 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TBX3	O15119	743 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	STBD1	O95210	358 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	C22orf31	O95567	290 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	OAT	P04181	439 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP2B1	P20020	1258 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAJB2	P25686	324 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	BANK1	Q8NDB2	785 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	COL1A2	P08123	1366 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		12.67	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	NEMF	O60524	1076 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	BAIAP3	O94812	1187 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	GHR	P10912	638 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MYOG	P15173	224 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	GJB2	P29033	226 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	DEFB103A	P81534	67 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	CALCRL	Q16602	461 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MARCH6	O60337	910 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	MCM7	P33993	719 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	NBR1	Q14596	966 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	LPIN1	Q14693	890 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF174	Q15697	407 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TPCN1-223	ENST00000552985	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	12.65	□□□□□ -0.38

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