RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SCP2P22307 547 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 RPA1P27694 616 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 MNAT1P51948 309 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 PSMD2Q13200 908 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 KCNJ12Q14500 433 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 KRT31Q15323 416 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 PTPN21Q16825 1174 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CEP55Q53EZ4 464 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 DYMQ7RTS9 669 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CPXCR1Q8N123 301 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 SLC5A5Q92911 643 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 P2RX5Q93086 422 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 THAP9Q9H5L6 903 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 RPTORQ8N122 1335 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 C19orf81C9J6K1 198 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 VWA5AO00534 786 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 TEX33O43247 280 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ALAS1P13196 640 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 IDEP14735 1019 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 PBX1P40424 430 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 KCNJ6P48051 423 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 LMAN1P49257 510 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 SLC12A3P55017 1021 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 UBXN2AP68543 259 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 EHHADHQ08426 723 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 COASYQ13057 564 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 PPP2R5CQ13362 524 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 PTPN14Q15678 1187 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 HPS3Q969F9 1004 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ATG4CQ96DT6 458 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 RNF181Q9P0P0 153 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 COL20A1Q9P218 1284 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 FZD1Q9UP38 647 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 EML1O00423 815 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 MEIS1O00470 390 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 N4BP3O15049 544 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 PSMD10O75832 226 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 NEBLO76041 1014 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CYP11B2P19099 503 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 RPS6KA3P51812 740 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 HMGCS2P54868 508 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CENPPQ6IPU0 288 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 GPBP1Q86WP2 473 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 TCP11Q8WWU5 503 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 SYT17Q9BSW7 474 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 PANK4Q9NVE7 773 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 DNM3Q9UQ16 869 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 RLFQ13129 1914 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GUA9 196 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-204ENST00000546621 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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