RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 RSPH3Q86UC2 560 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 HAS1Q92839 578 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 RSPH10BP0C881 870 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 ACTN1P12814 892 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.557e-7■■□□□ 12.1
PTPRK-222ENST00000532751 TRAPPC10P48553 1259 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 VAV3Q9UKW4 847 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 KIF28PB7ZC32 967 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 ATP4AP20648 1035 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 MCTP1Q6DN14 999 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 HERVK_113Q902F9 699 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 EVPLQ92817 2033 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-222ENST00000532751 TET1Q8NFU7 2136 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 OATP04181 439 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 MCM7P33993 719 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 RPAINQ86UA6 219 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 SNX21Q969T3 373 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 WNT7AO00755 349 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.541e-6■■□□□ 12.2
PTPRK-222ENST00000532751 CTSHP09668 335 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 PRKCEQ02156 737 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 TTC38Q5R3I4 469 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 EML1O00423 815 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 CXCL10P02778 98 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 KLRC1P26715 233 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 TXKP42681 527 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 EPHA7Q15375 998 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 UGCGQ16739 394 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 HSCBQ8IWL3 235 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 ZBBXA8MT70 800 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF862O60290 1169 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 NBNO60934 754 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 P4HBP07237 508 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 PDCP20941 246 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 PSMC5P62195 406 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF174Q15697 407 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 FAM26DQ5JW98 314 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 RASIP1Q5U651 963 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 BANK1Q8NDB2 785 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 VWCEQ96DN2 955 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 MTMR9Q96QG7 549 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 M0QZ92 97 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 GPNMBQ14956 572 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 XKR3Q5GH77 459 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 NME8Q8N427 588 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEB2O15479 319 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 BAIAP3O94812 1187 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 OR52Z1P0C646 297 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 IER5Q5VY09 327 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 LRCH3Q96II8 777 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 SIP14410 1827 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 C22orf31O95567 290 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 MBTPS1Q14703 1052 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-222ENST00000532751 GPR153Q6NV75 609 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRK-222ENST00000532751 NEK9Q8TD19 979 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRK-222ENST00000532751 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PTPRK-222ENST00000532751 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRK-222ENST00000532751 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRK-222ENST00000532751 EFCAB14O75071 495 aa24.62■■□□□ 1.53
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