RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	HOMER1	Q86YM7	354 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDHR1	Q96JP9	859 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT23	Q9C075	422 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691		B4E1Z4	1266 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	FSCN2	O14926	492 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	BRD1	O95696	1058 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	MARK3	P27448	753 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ERVFC1	P60507	584 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGBP1	P78318	339 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEMA3F	Q13275	785 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	CASP10	Q92851	521 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	APOL5	Q9BWW9	433 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	LZTS1	Q9Y250	596 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	CACNA1B	Q00975	2339 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	LAG3	P18627	525 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	GATM	P50440	423 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT17	Q04695	432 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ITIH3	Q06033	890 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ODR4	Q5SWX8	454 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	NME8	Q8N427	588 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	CUL5	Q93034	780 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCF25	Q9BQ70	676 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLXNA3	P51805	1871 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	DENND3	A2RUS2	1198 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	MTHFR	P42898	656 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT76	Q01546	638 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNC3	Q14003	757 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	FLCN	Q8NFG4	579 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PIGS	Q96S52	555 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	AZI2	Q9H6S1	392 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	KAT6A	Q92794	2004 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	INSRR	P14616	1297 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPM1A	P35813	382 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDE1A	P54750	535 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMC7	Q7Z402	723 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPRASP2	Q96D09	838 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TXNRD1-223	ENST00000531691	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TXNRD1-223	ENST00000531691	RILPL2	Q969X0	211 aa		12.83	□□□□□ -0.36

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