RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 VWCEQ96DN2 955 aa16.61■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.61■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 GPR20Q99678 358 aa16.61■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.61■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.61■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 OR52Z1P0C646 297 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 KRT76Q01546 638 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 PTGDRQ13258 359 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 NBR1Q14596 966 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 SLC9A2Q9UBY0 812 aa16.6■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 GAS7O60861 476 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 EFCAB14O75071 495 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 ATG7O95352 703 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 RABGGTBP53611 331 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 SP4Q02446 784 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 PPP2R5CQ13362 524 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 FAM173BQ6P4H8 233 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 RDM1Q8NG50 284 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 TEKT3Q9BXF9 490 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 VAV3Q9UKW4 847 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 EMSYQ7Z589 1322 aa16.59■□□□□ 0.25
BRMS1-204ENST00000525127 CXCL10P02778 98 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 SFNP31947 248 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 THPOP40225 353 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 PTPAQ15257 358 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 SERINC5Q86VE9 423 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 USP28Q96RU2 1077 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 CFAP45Q9UL16 551 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 CLIC4Q9Y696 253 aa16.58■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 RSPH10B2B2RC85 870 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 DLL1O00548 723 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 MARCH6O60337 910 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 CAND2O75155 1236 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 YEATS4O95619 227 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 CCNE2O96020 404 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 RSPH10BP0C881 870 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 ACTR2P61160 394 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 IKBKEQ14164 716 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 SLC39A14Q15043 492 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 A0A0C4DFX4 3053 aa16.57■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 NRCAMQ92823 1304 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 WDR64B1ANS9 1081 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 NBNO60934 754 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 HOXC8P31273 242 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TXKP42681 527 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 JAK3P52333 1124 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 PDIA5Q14554 519 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 ABHD15Q6UXT9 468 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 HERC6Q8IVU3 1022 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 LINC00301Q8NCQ3 95 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 GLG1Q92896 1179 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 GJA10Q969M2 543 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 UNC45AQ9H3U1 944 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.56■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.55■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TREHO43280 583 aa16.55■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 TLL1O43897 1013 aa16.55■□□□□ 0.24
BRMS1-204ENST00000525127 LGR5O75473 907 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms