RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, human

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2B-208	ENST00000511807	CTSH	P09668	335 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	COL9A1	P20849	921 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	ICAM3	P32942	547 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	PKP1	Q13835	747 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	NPY5R	Q15761	445 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	FERMT3	Q86UX7	667 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	TRIM50	Q86XT4	487 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	HLA-C	Q95604	372 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	TTC28	Q96AY4	2481 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.84	□□□□□ -0.35
UBE2B-208	ENST00000511807		M0R2N6	131 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	GNAT1	P11488	350 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ERVK-21	P61565	698 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	SEMA3F	Q13275	785 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	NR5A1	Q13285	461 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	OXER1	Q8TDS5	423 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	GPR20	Q99678	358 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.83	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	HOXC8	P31273	242 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ARHGAP4	P98171	946 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	REST	Q13127	1097 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	UBE2S	Q16763	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	NLRX1	Q86UT6	975 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	SEPT8	Q92599	483 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	INSL6	Q9Y581	213 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	UPP2	O95045	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TRAPPC10	P48553	1259 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TNFRSF25	Q93038	417 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ANO3	Q9BYT9	981 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TMEM260	Q9NX78	707 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	CAND2	O75155	1236 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	USP11	P51784	963 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	YME1L1	Q96TA2	773 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TET1	Q8NFU7	2136 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ATP9A	O75110	1047 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	MARK3	P27448	753 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	INF2	Q27J81	1249 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	NEK8	Q86SG6	692 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	NRCAM	Q92823	1304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	GHR	P10912	638 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ITGB5	P18084	799 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ATP2B1	P20020	1258 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF76	P36508	570 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	SREBF1	P36956	1147 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	KRT85	P78386	507 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	ADAM17	P78536	824 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	PPFIA1	Q13136	1202 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	MTMR1	Q13613	665 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	EPC2	Q52LR7	807 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	GLG1	Q92896	1179 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
UBE2B-208	ENST00000511807	TOP1MT	Q969P6	601 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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