RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ICAM1P05362 532 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CYP2J2P51589 502 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 TGFB2P61812 414 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 KSR1Q8IVT5 923 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 MTMR14Q8NCE2 650 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 MXRA8Q9BRK3 442 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 LXNQ9BS40 222 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 MLXIPQ9HAP2 919 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 WDR46O15213 610 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 MOCS3O95396 460 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNA1Q09470 495 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 MTMR2Q13614 643 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 EPHA7Q15375 998 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ASIC2Q16515 512 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 EXOC3L4Q17RC7 722 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM133AQ8N9E0 248 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 RDH13Q8NBN7 331 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC5A5Q92911 643 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 HSD17B14Q9BPX1 270 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 SMCHD1A6NHR9 2005 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 BUB1O43683 1085 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CDK17Q00537 523 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 PRKG1Q13976 671 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC181Q5TID7 509 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 EDEM3Q9BZQ6 932 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB129Q9H1M3 183 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 PICK1Q9NRD5 415 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF446Q9NWS9 450 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 SIPA1L1O43166 1804 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ACTN1P12814 892 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 TRIM58Q8NG06 486 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 SH2D3AQ9BRG2 576 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC9A1P19634 815 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CASP4P49662 377 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC70Q6NSX1 233 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 LPAR1Q92633 364 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 HACL1Q9UJ83 578 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 FRMD3A2A2Y4 597 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 SERPING1P05155 500 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 TUBB4BP68371 445 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 PPP2R5CQ13362 524 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXR2Q6PJQ5 311 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 FRMD5Q7Z6J6 570 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 BAP1Q92560 729 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF263O14978 683 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 DCAF15Q66K64 600 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 GBP6Q6ZN66 633 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM186BQ8IYM0 893 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 EXOC3O60645 756 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 PLA2G6O60733 806 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 AKAP3O75969 853 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 PTGER2P43116 358 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 SP4Q02446 784 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 MTMR1Q13613 665 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGEF16Q5VV41 709 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 IL31RAQ8NI17 732 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 TAAR1Q96RJ0 339 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 RMDN3Q96TC7 470 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 IKZF4Q9H2S9 585 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ITGB5P18084 799 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 RPS6P62753 249 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 PADI6Q6TGC4 694 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 NOX5Q96PH1 765 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 WRNIP1Q96S55 665 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 RIT2Q99578 217 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 FZD1Q9UP38 647 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 K7ENM7 598 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 BRD3Q15059 726 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 MUM1L1Q5H9M0 696 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF207Q6ZRF8 634 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-208ENST00000510829 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms