RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509593.1

ABCE1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 5

Gene ABCE1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-208	ENST00000509593	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CDC6	Q99741	560 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ENPP3	O14638	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	FOXS1	O43638	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	AMH	P03971	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	AMY2A	P04746	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PYGM	P11217	842 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	KRT15	P19012	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	AMY2B	P19961	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	TACR2	P21452	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GPR19	Q15760	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	AQP7	O14520	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	KCNK3	O14649	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	MUSK	O15146	869 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ASMTL	O95671	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PDE6A	P16499	860 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SELENOP	P49908	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	JAM2	P57087	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	WNT9A	O14904	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	HSD3B2	P26439	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	POLD1	P28340	1107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ST5	P78524	1137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	VPS11	Q9H270	941 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ARVCF	O00192	962 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CDC45	O75419	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CRTAM	O95727	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	DNM2	P50570	870 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	GYS2	P54840	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	RRAD	P55042	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CRY1	Q16526	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	APPBP2	Q92624	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	CUTA	O60888	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SLPI	P03973	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	SDS	P20132	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	PTGS1	P23219	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	MC4R	P32245	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCE1-208	ENST00000509593	ACVRL1	P37023	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms