RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	CNGA1	P29973	690 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MXI1	P50539	228 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CDR1	P51861	262 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ST5	P78524	1137 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF827	Q17R98	1081 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC102B	Q68D86	513 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SIX5	Q8N196	739 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ERMN	Q8TAM6	284 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP4K1	Q92918	833 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CYLD	Q9NQC7	956 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	DIAPH2	O60879	1101 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MYBL2	P10244	700 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RHOQ	P17081	205 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ADORA1	P30542	326 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	S100A5	P33763	92 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MCM2	P49736	904 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HSD17B7	P56937	341 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	AP2B1	P63010	937 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	DDR1	Q08345	913 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	GRAP	Q13588	217 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	NECTIN1	Q15223	517 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE3C	Q15386	1083 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC15A2	Q16348	729 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	ASIC4	Q96FT7	647 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TNIP3	Q96KP6	325 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	IL25	Q9H293	177 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	COL4A1	P02462	1669 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971	DOCK2	Q92608	1830 aa		7.46	□□□□□ -1.21
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0D9SFI3	127 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TAF5L	O75529	589 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RASGRP1	O95267	797 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	F2	P00734	622 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	BCR	P11274	1271 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP2B4	P23634	1241 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	NF2	P35240	595 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MCAM	P43121	646 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PHKA1	P46020	1223 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	BAG6	P46379	1132 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	APBA1	Q02410	837 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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