RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 STIM1Q13586 685 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 GPR153Q6NV75 609 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 DYMQ7RTS9 669 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ADSSL1Q8N142 457 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM5Q9C035 493 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 GDAQ9Y2T3 454 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa11.95□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 WDR64B1ANS9 1081 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ADCY3O60266 1144 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 LYPLA2O95372 231 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PRCPP42785 496 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF75DP51815 510 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 EHHADHQ08426 723 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PAK1Q13153 545 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 WDR78Q5VTH9 848 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 SPATA1Q5VX52 437 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 MED15Q96RN5 788 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 LXNQ9BS40 222 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PORCNQ9H237 461 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PANK4Q9NVE7 773 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.94□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 STRNO43815 780 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 CCNE2O96020 404 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 INHAP05111 366 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 IDEP14735 1019 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 CDC25BP30305 580 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 FLT3LGP49771 235 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 STK4Q13043 487 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 COASYQ13057 564 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 IRF5Q13568 498 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 GIT2Q14161 759 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ARSHQ5FYA8 562 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 BANK1Q8NDB2 785 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 MORC4Q8TE76 937 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 NELFBQ8WX92 580 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 FGD4Q96M96 766 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFB118Q96PH6 123 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 FANCLQ9NW38 375 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 GABRQQ9UN88 632 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 SAMM50Q9Y512 469 aa11.93□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ASB14A6NK59 587 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PSMA7O14818 248 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PGK2P07205 417 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 TGFB3P10600 412 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ELNP15502 786 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 BMP8BP34820 402 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 STX17P56962 302 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PSMC5P62195 406 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 FANCCQ00597 558 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 C4orf19Q8IY42 314 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 KCND2Q9NZV8 630 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 MCM3APO60318 1980 aa11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 MGAMO43451 1857 aa11.91□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 MYH11P35749 1972 aa11.91□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.91□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 BICDL2A1A5D9 508 aa11.91□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.91□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 CBFA2T2O43439 604 aa11.91□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 PSAPP07602 524 aa11.91□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF18P17022 549 aa11.91□□□□□ -0.5
ECHDC3-204ENST00000495787 CCNE1P24864 410 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms