RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TTLL6Q8N841 843 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 STK32BQ9NY57 414 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 AKAP3O75969 853 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 GCNT3O95395 438 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 MCTP2Q6DN12 878 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 OGFOD1Q8N543 542 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 GANQ9H2C0 597 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 GOPCQ9HD26 462 aa14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 SLC26A4O43511 780 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 EYA4O95677 639 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 EPS15P42566 896 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 CREG2Q8IUH2 290 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 SNX12Q9UMY4 172 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 ANO9A1A5B4 782 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 PSMD10O75832 226 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 DPEP1P16444 411 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 SRLQ86TD4 932 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TRIM58Q8NG06 486 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 SERPING1P05155 500 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 DGKZQ13574 1117 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 VCPKMTQ9H867 229 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 ASTN1O14525 1302 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 A0A087X0T9 212 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 NR3C1P04150 777 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 FAM228BP0C875 321 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 INPP5BP32019 993 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 DNA2P51530 1060 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 LDHDQ86WU2 507 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 CCDC102AQ96A19 550 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 KCNA3P22001 575 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TUBB4BP68371 445 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 COG2Q14746 738 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 CASP8Q14790 479 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 MYCT1Q8N699 235 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 PDXKO00764 312 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 PJA2O43164 708 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TGFB1I1O43294 461 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 GAS7O60861 476 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 CAP2P40123 477 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 CEP55Q53EZ4 464 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 GJB7Q6PEY0 223 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 SLC5A5Q92911 643 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 FAM13AO94988 1023 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 MYBL2P10244 700 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 KLRC1P26715 233 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-213ENST00000492657 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms