RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 TEKT3Q9BXF9 490 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 BRMS1Q9HCU9 246 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 DISC1Q9NRI5 854 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa13.58□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TRANK1O15050 2925 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CAND2O75155 1236 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CHRNA1P02708 482 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MMP1P03956 469 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 SLC26A2P50443 739 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 WDR5P61964 334 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 DEFB103AP81534 67 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 UGCGQ16739 394 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 DBF4BQ8NFT6 615 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MSRAQ9UJ68 235 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 GBF1Q92538 1859 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MYO9BQ13459 2157 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ZNF862O60290 1169 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 HBP1O60381 514 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 BAIAP3O94812 1187 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 KCNJ6P48051 423 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MGAT3Q09327 533 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 RAB30Q15771 203 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 FAM26DQ5JW98 314 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MTHFD1LQ6UB35 978 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MIER3Q7Z3K6 550 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 RPAINQ86UA6 219 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 RSPH3Q86UC2 560 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ZNF576Q9H609 170 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 WNT7AO00755 349 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ST18O60284 1047 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 GHRP10912 638 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 KLRC1P26715 233 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 JAK3P52333 1124 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 IKBKEQ14164 716 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 GRIN2CQ14957 1233 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 POTEDQ86YR6 584 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 HERC6Q8IVU3 1022 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MYLIPQ8WY64 445 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 SEPT8Q92599 483 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 C8orf76Q96K31 380 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 SLC9A7Q96T83 725 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PTPRSQ13332 1948 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 WDR81Q562E7 1941 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TMEM265A0A087WTH1 108 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 EML1O00423 815 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 MARCH6O60337 910 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 SFNP31947 248 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PRKCEQ02156 737 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 LPIN1Q14693 890 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 FAM184AQ8NB25 1140 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 HAS1Q92839 578 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 FAM20AQ96MK3 541 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 VAV3Q9UKW4 847 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 COL1A2P08123 1366 aa13.54□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 SIP14410 1827 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 TMEM150BA6NC51 233 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 ARHGEF15O94989 841 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 C22orf31O95567 290 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 OATP04181 439 aa13.53□□□□□ -0.24
NISCH-214ENST00000490425 CA3P07451 260 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms