RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIM75P	A6NK02	468 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	YDJC	A8MPS7	323 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CYTH3	O43739	400 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF202	O95125	648 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DOA	P06340	250 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMD2	Q13200	908 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	IQCB1	Q15051	598 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	STX1A	Q16623	288 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SARM1	Q6SZW1	724 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	FERMT2	Q96AC1	680 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	MTMR8	Q96EF0	704 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP95	Q96GE4	821 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC18	Q9H819	358 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CBX8	Q9HC52	389 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	BARHL2	Q9NY43	387 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SLX4	Q8IY92	1834 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TCHH	Q07283	1943 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GVL5	298 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL12	A8MUP2	240 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	KLRF2	D3W0D1	207 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01387	J3KSC0	135 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	STXBP3	O00186	592 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	TTLL1	O95922	423 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	RECK	O95980	971 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PDHB	P11177	359 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	EDN3	P14138	238 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	EPHA1	P21709	976 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SYK	P43405	635 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	DAB2	P98082	770 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	NFIA	Q12857	509 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CAMK4	Q16566	473 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	AOC3	Q16853	763 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	BLID	Q8IZY5	108 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF214	Q8ND24	703 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA20	Q8TB22	786 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	MXD3	Q9BW11	206 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	NYAP2	Q9P242	653 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PP55	124 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	LAD1	O00515	517 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIP5K2	O43314	1243 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO1B	O43795	1136 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	AKR1B1	P15121	316 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	DPEP1	P16444	411 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	VAMP1	P23763	118 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	PRPH	P41219	470 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF165	P49910	485 aa		6.3	□□□□□ -1.4

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