RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486234.1

AUP1-208, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene AUP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-208ENST00000486234 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 DPF3Q92784 378 aa14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 NOD1Q9Y239 953 aa14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.67□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 CENPFP49454 3210 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 POTEMA6NI47 508 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 SPTLC2O15270 562 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 CAND2O75155 1236 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 CAPN15O75808 1086 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 CLTBP09497 229 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 INSRRP14616 1297 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 ATP4AP20648 1035 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 MARK3P27448 753 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 CHMP4BP1P59074 171 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 PRKCEQ02156 737 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 PTK7Q13308 1070 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 BFSP2Q13515 415 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 GRIK4Q16099 956 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 PTGISQ16647 500 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 TPH2Q8IWU9 490 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 DYDC2Q96IM9 177 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 NACC1Q96RE7 527 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 LXNQ9BS40 222 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.66□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 ZNF862O60290 1169 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 B4GALT4O60513 344 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 ADAM17P78536 824 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 FAAP100Q0VG06 881 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 IL17AQ16552 155 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 RPAINQ86UA6 219 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 RSPH3Q86UC2 560 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 BANK1Q8NDB2 785 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 CAGE1Q8TC20 777 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.65□□□□□ -0.06
AUP1-208ENST00000486234 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 KIAA0355O15063 1070 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 STBD1O95210 358 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 TXLNAP40222 546 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 UBA7P41226 1012 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 RBL2Q08999 1139 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 UGCGQ16739 394 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 HYIQ5T013 277 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 SERINC5Q86VE9 423 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 NME8Q8N427 588 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 RETREG2Q8NC44 543 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 SETD4Q9NVD3 440 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 RGL1Q9NZL6 768 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.64□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 PITPNM1O00562 1244 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CUTAO60888 179 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 TMOD1P28289 359 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 RFC5P40937 340 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CDC42EP1Q00587 391 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CYP4A11Q02928 519 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CALML4Q96GE6 196 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 TBX21Q9UL17 535 aa14.63□□□□□ -0.07
AUP1-208ENST00000486234 DNM3Q9UQ16 869 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms