RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-209ENST00000486016 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.32□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 Q6ZSN1 163 aa6.32□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.32□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.32□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.32□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 PLSCR1O15162 318 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 GJA4P35212 333 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 ETV4P43268 484 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 HERVK_113P62684 666 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 GUCY1A3Q02108 690 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 WNK4Q96J92 1243 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CDC6Q99741 560 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 AMNQ9BXJ7 453 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 GALNT8Q9NY28 637 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.31□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CRTAMO95727 393 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 TGM1P22735 817 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 PTGS1P23219 599 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 MC4RP32245 332 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 KLF10Q13118 480 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 NFYCQ13952 458 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 RASA3Q14644 834 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 TBR1Q16650 682 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 AGBL4Q5VU57 503 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 FUKQ8N0W3 1084 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 EDAQ92838 391 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 INCENPQ9NQS7 918 aa6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CCDC66A2RUB6 948 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 NAT1P18440 290 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 RAC3P60763 192 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 TM4SF20Q53R12 229 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 KANK2Q63ZY3 851 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CFHR4Q92496 578 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.29□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 KCNK3O14649 394 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 RAD17O75943 681 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 KRT15P19012 456 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CR2P20023 1033 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 COMTP21964 271 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 CRY1Q16526 586 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 JMYQ8N9B5 988 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 SCYL1Q96KG9 808 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 BTBD2Q9BX70 525 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.28□□□□□ -1.4
GCFC2-209ENST00000486016 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 GSTA4O15217 222 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 RBL2Q08999 1139 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF503Q96F45 646 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 SCLYQ96I15 445 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 ADOQ96SZ5 270 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 FBXO10Q9UK96 956 aa6.27□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 RASSF10A6NK89 507 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 KCNA6P17658 529 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 ATP2B1P20020 1258 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 ECE1P42892 770 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 DNM2P50570 870 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 RRADP55042 308 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 ST5P78524 1137 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 FOXE3Q13461 319 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 HS1BP3Q53T59 392 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 MIIPQ5JXC2 388 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GCFC2-209ENST00000486016 DLG3Q92796 817 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms