RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL4A6Q14031 1691 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR64B1ANS9 1081 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 TLL1O43897 1013 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 HBP1O60381 514 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 GJB5O95377 273 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 AMHP03971 560 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 MBOAT7Q96N66 472 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRANK1O15050 2925 aa21.33■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.33■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 GAS7O60861 476 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TDP2O95551 362 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SAMM50Q9Y512 469 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SFNP31947 248 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 JAK3P52333 1124 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 INF2Q27J81 1249 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 IER5Q5VY09 327 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM167AQ96KS9 214 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 M0QZ92 97 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 GHRP10912 638 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP4AP20648 1035 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAP1Q03518 808 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LPIN1Q14693 890 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEK8Q86SG6 692 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 RDM1Q8NG50 284 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAD9AQ99638 391 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 DISC1Q9NRI5 854 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYO9BQ13459 2157 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMD10O75832 226 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 NME8Q8N427 588 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SQORQ9Y6N5 450 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 EVPLQ92817 2033 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCHNA4D1U4 455 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHMP2AO43633 222 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 DTNBO60941 627 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGEF15O94989 841 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLRC1P26715 233 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRT2P35908 639 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ST3GAL1Q11201 340 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADGRE1Q14246 886 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LETM2Q2VYF4 491 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP38Q8NB14 1042 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 OXER1Q8TDS5 423 aa21.28■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC37A4O43826 429 aa21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 JAK2O60674 1132 aa21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 C22orf31O95567 290 aa21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 GJA10Q969M2 543 aa21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF2CQ99661 725 aa21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 INSL6Q9Y581 213 aa21.27■■□□□ 1
TRAPPC10-208ENST00000469521 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.26■□□□□ 0.99
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